Βιολογία κεφάλαιο 4

[menual]

Βοήθεια στο θέμα β

 

[Joji]

Βοήθεια στο θέμα β

Β2.1.

Στην περίπτωση ενός γραμμικού μορίου θα έχεις ν κοψίματα και ν+1 κομμάτια από τα οποία τα δυο δεν θα μπορούν να κλωνοποιηθούν αν δεν υποστούν επεξεργασία λόγω του ότι τα δυο ακριανά δεν θα διαθέτουν μονόκλωνα άκρα και στις δυο μεριές. Στην περίπτωση των κυκλικών έχεις ν κοψίματα και ν κομμάτια εκ των οποίων όλα μπορούν να κλωνοποιηθούν.

Στην παρακάτω εικόνα σου παραθέτω παράδειγμα. Τα για κομμάτια που πρέπει να υποστούν επεξεργασία για να κλωνοποιηθούν και τα για τα κομμάτια που μπορούν να κλωνοποιηθούν απευθείας.

Όποτε σκέψου αρχικά αν το μιτοχονδριακό DNA είναι κυκλικό ή γραμμικό και έπειτα δες αυτά που σου είπα.

 

[spring day]

Για το Β4: Ένα πλασμίδιο πρέπει να έχει μια μόνο φορά την αλληλουχία που αναγνωρίζει η π.ε που θα χρησιμοποιηθεί. Άρα απορρίπτουμε την π.ε Ν καθώς κόβει δύο το πλασμίδιο σε δύο θέσεις.
Η π.ε Ζ κόβει τον υποκινητή του γονιδίου που προσδίδει ανθεκτικότητα στην αμπικιλλίνη άρα το γονίδιο αυτό δεν εκφράζεται στα βακτήρια που μετασχηματίζονται με το εν λόγω πλασμίδιο, δηλαδή τα βακτήρια θα είναι ευαίσθητα σε αυτό το αντιβιοτικό. Τα μη μετασχηματισμένα βακτήρια θα είναι επίσης ευαίσθητα (στο βιβλίο αναφέρει ότι "Συνήθως χρησιμοποιούνται ως ξενιστές, βακτήρια που δεν έχουν πλασμίδια και επομένως είναι ευαίσθητα σε αντιβιοτικά", φαντάζομαι το ίδιο ισχύει και σε αυτή την άσκηση γιατί δεν το αναφέρει ξεκάθαρα). Ωστόσο, το γονίδιο ανθεκτικότητας στην τετρακυκλίνη παραμένει άθικτο άρα τα μετασχηματισμένα βακτήρια θα είναι ανθεκτικά στην τετρακυκλίνη. Καλλιεργώντας και τα δύο είδη βακτηρίων σε θρεπτικό υλικό που περιέχει τετρακυκλίνη επιβιώνουν τελικά μόνο τα μετασχηματισμένα.

 

[Joji]

Για το Β4: Ένα πλασμίδιο πρέπει να έχει μια μόνο φορά την αλληλουχία που αναγνωρίζει η π.ε που θα χρησιμοποιηθεί. Άρα απορρίπτουμε την π.ε Ν καθώς κόβει δύο το πλασμίδιο σε δύο θέσεις.
Η π.ε Ζ κόβει τον υποκινητή του γονιδίου που προσδίδει ανθεκτικότητα στην αμπικιλλίνη άρα το γονίδιο αυτό δεν εκφράζεται στα βακτήρια που μετασχηματίζονται με το εν λόγω πλασμίδιο, δηλαδή τα βακτήρια θα είναι ευαίσθητα σε αυτό το αντιβιοτικό. Τα μη μετασχηματισμένα βακτήρια θα είναι επίσης ευαίσθητα (στο βιβλίο αναφέρει ότι "Συνήθως χρησιμοποιούνται ως ξενιστές, βακτήρια που δεν έχουν πλασμίδια και επομένως είναι ευαίσθητα σε αντιβιοτικά", φαντάζομαι το ίδιο ισχύει και σε αυτή την άσκηση γιατί δεν το αναφέρει ξεκάθαρα). Ωστόσο, το γονίδιο ανθεκτικότητας στην τετρακυκλίνη παραμένει άθικτο άρα τα μετασχηματισμένα βακτήρια θα είναι ανθεκτικά στην τετρακυκλίνη. Καλλιεργώντας και τα δύο είδη βακτηρίων σε θρεπτικό υλικό που περιέχει τετρακυκλίνη επιβιώνουν τελικά μόνο τα μετασχηματισμένα.

Ερώτηση, δίκη μου, η άσκηση αναφέρετε αποκλειστικά σε δυο αποικίες, εκείνη με τα μετασχηματισμένα βακτήρια που έχουν το ανασυνδυασμένο πλασμίδιο και εκείνη που δεν έχουν δεχτεί τα βακτήρια πλασμίδιο (μη μετασχηματισμένα); Πρέπει να συμπεριλάβουμε ίσως και την τρίτη όπου έχουμε μετασχηματισμένα βακτήρια αλλά όχι ανασυνδυασμένο πλασμίδιο, να βάλουμε αρχικά τετρακυκλίνη στην οποία είναι και τα δυο ανθεκτικά πλην των μη μετασχηματισμένων (ώστε να τα ξεφορτωθούμε) και μετά να πάρουμε δείγμα και να προσθέσουμε αμπικυλίνη; Πως πάει;

Η καθηγήτρια μου, είχε πει πάντα να κάνουμε αναφορά και στις 3 αποικίες απλώς επειδή στην συγκεκριμένη άσκηση είναι λίγο πιο συγκεκριμένο το ερώτημα «αποικίες που μετασχηματίζονται με το εν λόγω πλασμίδιο», γι’αυτό ρωτάω.

 

[spring day]

Ερώτηση, δίκη μου, η άσκηση αναφέρετε αποκλειστικά σε δυο αποικίες, εκείνη με τα μετασχηματισμένα βακτήρια που έχουν το ανασυνδυασμένο πλασμίδιο και εκείνη που δεν έχουν δεχτεί τα βακτήρια πλασμίδιο (μη μετασχηματισμένα); Πρέπει να συμπεριλάβουμε ίσως και την τρίτη όπου έχουμε μετασχηματισμένα βακτήρια αλλά όχι ανασυνδυασμένο πλασμίδιο, να βάλουμε αρχικά τετρακυκλίνη στην οποία είναι και τα δυο ανθεκτικά πλην των μη μετασχηματισμένων (ώστε να τα ξεφορτωθούμε) και μετά να πάρουμε δείγμα και να προσθέσουμε αμπικυλίνη; Πως πάει;

Η καθηγήτρια μου, είχε πει πάντα να κάνουμε αναφορά και στις 3 αποικίες απλώς επειδή στην συγκεκριμένη άσκηση είναι λίγο πιο συγκεκριμένο το ερώτημα «αποικίες που μετασχηματίζονται με το εν λόγω πλασμίδιο», γι’αυτό ρωτάω.

Για να είμαι ειλικρινής δεν θυμάμαι καθόλου αν πρέπει να κάνουμε αναφορά και στις 3 αποικίες αλλά για να το είπε η καθηγήτρια σου πρέπει να έχει δίκιο. Γιαυτό και αναφέρθηκα μόνο στις 2 που ζητάει. Τώρα γιαυτό που λες, ναι έτσι πάει. Καλλιεργουνται αρχικά τα βακτήρια σε στερεό υλικό που περιέχει μόνο τετρακυκλίνη και αναπτύσσονται τα βακτήρια που έχουν πλασμιδιο είτε ανασυνδυασμένο είτε μη. Μετά δημιουργείται ένα αντίγραφο της καλλιέργειας αυτής (σαν διαδικασία δεν είναι στην ύλη, δεν χρειάζεται να πεις κάτι περισσότερο) αλλά σε θρεπτικό υλικό με τετρακυκλίνη όπου αναπτύσσονται μόνο τα μετασχηματισμένα με μη ανασυνδυασμένο πλασμίδιο. Συγκρίνοντας τις δύο αποικίες προκύπτει ότι αυτές που υπάρχουν στην πρώτη καλλιέργεια και όχι στην δεύτερη είναι αυτές με το ανασυνδυασμένο πλασμίδιο.